隠しエリア探し
飛空艇入手後、コントロール画面の「インプット」（パスワード入力）か「サーチ」（地図上の座標指定）で隠しエリアを発見できます。 発見すると行き先リストに追加され、以後は自由に行けます。隠しエリアは全部で9か所です。
サーチで見つかるエリア
地図上でカーソルを動かし、画面左に表示される座標（X・Y）が範囲内に入ったときに決定します。座標のヒントはゲーム内にはありません。
| エリア | X | Y | 手に入るもの |
|---|---|---|---|
| バージ=エボン寺院 | 11〜16 | 57〜63 | アニマ、ナイト・オブ・タマネギ、ラストエリクサー、メガフェニックス×4。ジオスゲイノ（2回目）と戦う |
| ビサイド虹の滝 | 29〜32 | 73〜76 | ドラグーンスピア（キマリ用武器：魔法カウンター・回避カウンター、空き2） |
| ミヘン海上遺跡 | 33〜36 | 55〜60 | パスファインダー（リュック用武器：先制・毒攻撃改、空き1）。宝箱が見えにくいので○ボタンを連打しながら移動 |
| キノコ岩戦場跡 | 39〜43 | 56〜60 | ファントムリング（ルールー用防具：氷吸収・炎吸収・水吸収） |
| サヌビアの砂丘 | 12〜16 | 41〜45 | アスカロン（ティーダ用武器：AP2倍） |
| オメガ遺跡 | 69〜75 | 33〜38 | 魔力スフィア、テレポスフィア、フレンドスフィア、アルベド語辞書第26巻、アタリ宝箱の装備。アルテマウェポン、オメガウェポンと戦う |
パスワードで行けるエリア
パスワードはひらがなで入力します（カタカナでは正しいと判定されません）。解読しなくても正しいパスワードを入力すれば発見できます。
| エリア | パスワード | 手に入るもの |
|---|---|---|
| キノコ岩谷底 | ごっどはんど | ゴッドハンド（リュックの七曜の武器） |
| ビサイド遺跡1 | ぴくとりあす | ビクトリアス（リュック用防具：雷無効・炎無効・氷無効、空き1） |
| ビサイド遺跡2 | むらさめ | 村雨（アーロン用武器：貫通・MP消費1、空き2） |
パスワードの解読
ごっどはんど
ミヘン街道・南端の遺跡の内壁に「広大な平原にある、谷に近い大きなトゲの、谷とは反対側を見よ」という内容が書かれています。ナギ平原の指定の場所へ行くと、次のメッセージへの方向と歩数が順に示され、最後の場所でパスワードが分かります。
ぴくとりあす
ビサイド島・遺跡の道のメッセージ「キーリカとビーカネルを重ねよ」に従い、キーリカの森のメッセージ「ぱわど ぴとあ」とサヌビア砂漠・中央部のメッセージ「すーは くりす」を上下に重ねて縦に読むと「ぱすわーどは ぴくとりあす」になります。
むらさめ
海の遺跡・海域の柱に「雷が降りそそぐ場所で、マカラーニャ方面から数えて4つ目の塔の右側を見よ」とあります。歩いて行けない範囲の避雷塔も数えて、雷平原・北部の該当する避雷塔を調べるとパスワードが分かります。
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